DeltaISIS is opgericht in 2002. Juist toen de economie en de IT-sector in het bijzonder in een laagconjunctuur zaten is DeltaISIS, toen onder de naam InfraQon, gestart. Het lef dat vereist was om te durven starten is nog altijd kenmerkend voor DeltaISIS. Aanvankelijk is het bedrijf gestart met het aanbieden van de producten en diensten zoals die nog altijd aangeboden worden onder de noemer Infrastructuur Services. In de eerste jaren heeft de organisatie een rustige groei doorgemaakt. In die periode is een stabiele basis gelegd voor het huidige portfolio en de huidige klantenkring.

In 2005 is het portfolio uitgebreid met Implementatie Services, een vorm van dienstverlening waar diverse medewerkers eerder ervaring mee hebben opgedaan. Gelijk met de verbreding van het portfolio is de naam DeltaISIS geïntroduceerd. De uitbreiding van de portfolio en de aantrekkende markt voor Infrastructuur Services hebben in 2005 geleid tot een verdubbeling van het aantal medewerkers, een trend die in 2006 is voortgezet. Ook in de toekomst verwacht DeltaISIS een ambitieuze groei door te kunnen maken.